Na prijedlog predsjednika Udruženja, Upravni odbor formira strukovne odbore iz pojedinih oblasti saobraćaja.
Svaki strukovni odbor broji najmanje 5 članova od kojih je jedan Predsjednik Strukovnog odbora. U okviru Udruženja postoji 20 Strukovnih odbora.
Upravni odbor može da formira i nove odbore ukoliko se ukaže potreba kao i da rasformira postojeće.
U udruženju imamo slijedeće strukovne odbore:
1. Odbor za javni cestovni saobraćaj
2. Odbor za željeznički saobraćaj
3. Odbor za vazdušni saobraćaj
4. Odbor za telekomunikacije
5. Odbor za poštanski saobraćaj
6. Odbor za cestovnu/putnu infrastrukturu
7. Odbor za planiranje u saobraćaju
8. Odbor za logistiku u saobraćaju
9. Odbor za sigurnost u saobraćaju
10. Odbor za edukaciju u saobraćaju
11. Odbor Sarajevo
12. Odbor Tuzla
13. Odbor Banja Luka
14. Odbor Mostar
15. Odbor Zenica
16. Odbor Bihać
17. Odbor Bijeljina
18. Odbor Doboj
19. Odbor Livno
20. Odbor za međunarodnu saradnju
21. Odbor za vještačenja u saobraćaju i komunikacijama